Na sequência da desativação bem-sucedida do sistema ctOS em Chicago por parte de Aiden Pearce, a Blume Corporation quadruplicou os seus esforços. O ctOS 2.0 foi lançado no centro de Silicon Valley, estabelecendo a ligação com milhares de milhões de dispositivos e criando perfis digitais completos de cada cidadão... o que dá aos governos corruptos, às corporações e aos criminosos o poder para aceder, rastrear, roubar e vender os dados pessoais.

A DedSec está aqui para recuperar esse poder.

Tu és Marcus Holloway, um jovem e brilhante hacker e o mais recente recruta da secção de São Francisco da DedSec. Estás equipado com um impressionante leque de capacidades e ferramentas – incluindo um carro de controlo remoto e um drone – e tens toda a Bay Area de São Francisco ao teu dispor, desde o Silicon Valley até às ruas da baixa da cidade. Entra em todos os dispositivos eletrónicos, sistemas informáticos ou veículos, recolhe informações de todos os cidadãos e infiltra-te na infraestrutura de uma cidade inteira enquanto lutas ao lado da comunidade hacker contra um sistema imoral.